Lotus Notes versión 4.6 salió al mercado en septiembre del 1997. En ese momento Lotus Notes contenía 5.694.358 líneas de código. Las principales mejoras de esta versión estuvieron encaminadas a la integración de la información personal, el manejo del contenido desde las bases de datos Notes, el correo de Internet y la Web. Se añadieron más protocolos de Internet en Notes. A finales de 1997 se habían instalado 20 millones de unidades de Lotus Notes en el mundo, doblando la cantidad anterior (10 millones de unidades) en solo un año. Esta nueva versión estaba disponibles para Windows NT, Windows 95, OS/2, Netware, UNIX y AS/400.

Funcionalidad incorporada:

• Una nueva mejora en el interface de usuario llamada "Portfolio" orientada a la navegación.
• Soporte de correo Internet (POP3 y SMTP) en el cliente Notes.
• Nuevas opciones de creación de mensajes de correo a partir de tareas, ítems de agenda y otros mensajes.
• Libreta de direcciones personal mejorada.
• Integración de Internet Explorer como navegador dentro de Notes.
• Mejoras en la integración con Microsoft Office y Lotus SmartSuite.
• Soporte del estándar de Internet sobre claves de correo y directorios (IMAP4/MIME y NNTP).
• Menor coste simplificando la instalación, configuración y la administración de los servidores Domino.